MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus intermedius JTH08

Total Repeats: 42052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018073	A	9	9	57	65	100 %	0 %	0 %	0 %	392427892
2	NC_018073	TTAA	2	8	97	104	50 %	50 %	0 %	0 %	392427892
3	NC_018073	CTT	2	6	130	135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392427892
4	NC_018073	ATT	2	6	153	158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427892
5	NC_018073	TCA	2	6	182	187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392427892
6	NC_018073	AAT	2	6	211	216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392427892
7	NC_018073	AAG	2	6	242	247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427892
8	NC_018073	CAA	2	6	269	274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427892
9	NC_018073	TCC	2	6	306	311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392427892
10	NC_018073	CAA	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427892
11	NC_018073	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427892
12	NC_018073	TGG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392427892
13	NC_018073	CTA	2	6	472	477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392427892
14	NC_018073	AT	3	6	528	533	50 %	50 %	0 %	0 %	392427892
15	NC_018073	CTG	2	6	536	541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392427892
16	NC_018073	ATTG	2	8	627	634	25 %	50 %	25 %	0 %	392427892
17	NC_018073	GAAA	2	8	656	663	75 %	0 %	25 %	0 %	392427892
18	NC_018073	AAG	2	6	674	679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427892
19	NC_018073	T	6	6	682	687	0 %	100 %	0 %	0 %	392427892
20	NC_018073	GAA	2	6	769	774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427892
21	NC_018073	CCA	2	6	820	825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392427892
22	NC_018073	AGA	2	6	864	869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427892
23	NC_018073	TC	3	6	964	969	0 %	50 %	0 %	50 %	392427892
24	NC_018073	TGC	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392427892
25	NC_018073	CAAAT	2	10	1046	1055	60 %	20 %	0 %	20 %	392427892
26	NC_018073	GAT	2	6	1294	1299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427892
27	NC_018073	TAGAAA	2	12	1310	1321	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392427892
28	NC_018073	A	6	6	1326	1331	100 %	0 %	0 %	0 %	392427892
29	NC_018073	GAT	2	6	1340	1345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427892
30	NC_018073	A	6	6	1361	1366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018073	CA	3	6	1434	1439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018073	ACT	2	6	1450	1455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018073	TAA	2	6	1469	1474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018073	ATA	2	6	1482	1487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018073	TAA	2	6	1517	1522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392427893
36	NC_018073	ATTT	2	8	1525	1532	25 %	75 %	0 %	0 %	392427893
37	NC_018073	ACC	2	6	1548	1553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392427893
38	NC_018073	ATTG	2	8	1631	1638	25 %	50 %	25 %	0 %	392427893
39	NC_018073	TAA	2	6	1702	1707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392427893
40	NC_018073	CTT	2	6	1708	1713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392427893
41	NC_018073	T	6	6	1740	1745	0 %	100 %	0 %	0 %	392427893
42	NC_018073	TGT	2	6	1751	1756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392427893
43	NC_018073	AGTA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	392427893
44	NC_018073	ATT	2	6	1932	1937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427893
45	NC_018073	GTC	2	6	1972	1977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392427893
46	NC_018073	AGA	2	6	2062	2067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427893
47	NC_018073	GAA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427893
48	NC_018073	TGT	2	6	2099	2104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392427893
49	NC_018073	GAT	2	6	2148	2153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427893
50	NC_018073	AAT	2	6	2181	2186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392427893
51	NC_018073	TCT	2	6	2336	2341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392427893
52	NC_018073	TTAG	2	8	2391	2398	25 %	50 %	25 %	0 %	392427893
53	NC_018073	GAA	2	6	2436	2441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427893
54	NC_018073	TTA	2	6	2574	2579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427893
55	NC_018073	TGA	2	6	2585	2590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427893
56	NC_018073	ATG	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018073	TTG	2	6	2655	2660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018073	A	6	6	2702	2707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018073	ATT	2	6	2723	2728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018073	A	6	6	2812	2817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018073	T	6	6	2846	2851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018073	ATC	2	6	2877	2882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392427894
63	NC_018073	T	6	6	2940	2945	0 %	100 %	0 %	0 %	392427894
64	NC_018073	TCT	2	6	3127	3132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392427894
65	NC_018073	T	6	6	3132	3137	0 %	100 %	0 %	0 %	392427894
66	NC_018073	TAG	2	6	3173	3178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427894
67	NC_018073	TTTGT	2	10	3179	3188	0 %	80 %	20 %	0 %	392427894
68	NC_018073	ACA	2	6	3190	3195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427894
69	NC_018073	TAA	2	6	3205	3210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392427894
70	NC_018073	T	7	7	3265	3271	0 %	100 %	0 %	0 %	392427894
71	NC_018073	TGA	2	6	3296	3301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427894
72	NC_018073	CAA	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427894
73	NC_018073	AAT	2	6	3328	3333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392427894
74	NC_018073	T	7	7	3347	3353	0 %	100 %	0 %	0 %	392427894
75	NC_018073	CCT	2	6	3364	3369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018073	TAA	2	6	3376	3381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018073	A	6	6	3403	3408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018073	AAT	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018073	ATTGA	2	10	3471	3480	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018073	CAG	2	6	3512	3517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392427895
81	NC_018073	TTTA	2	8	3552	3559	25 %	75 %	0 %	0 %	392427895
82	NC_018073	CAA	2	6	3605	3610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427895
83	NC_018073	TCA	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392427895
84	NC_018073	CAA	2	6	3933	3938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427895
85	NC_018073	A	6	6	3956	3961	100 %	0 %	0 %	0 %	392427895
86	NC_018073	AAAGAT	2	12	3976	3987	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392427895
87	NC_018073	A	6	6	4013	4018	100 %	0 %	0 %	0 %	392427895
88	NC_018073	TGA	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427895
89	NC_018073	AGA	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427895
90	NC_018073	A	6	6	4079	4084	100 %	0 %	0 %	0 %	392427895
91	NC_018073	ATT	2	6	4095	4100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427895
92	NC_018073	ATA	2	6	4166	4171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392427895
93	NC_018073	GCA	2	6	4201	4206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392427895
94	NC_018073	GTA	2	6	4222	4227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427895
95	NC_018073	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427895
96	NC_018073	GAT	2	6	4267	4272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427895
97	NC_018073	TGAA	2	8	4307	4314	50 %	25 %	25 %	0 %	392427895
98	NC_018073	AGC	2	6	4338	4343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392427895
99	NC_018073	TTA	2	6	4351	4356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427895
100	NC_018073	ACTT	2	8	4366	4373	25 %	50 %	0 %	25 %	392427895
101	NC_018073	AAG	2	6	4388	4393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427895
102	NC_018073	CAC	2	6	4427	4432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392427895
103	NC_018073	AGC	2	6	4434	4439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392427895
104	NC_018073	ATG	2	6	4496	4501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427895
105	NC_018073	GAA	2	6	4555	4560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427895
106	NC_018073	AT	3	6	4569	4574	50 %	50 %	0 %	0 %	392427895
107	NC_018073	AAT	2	6	4651	4656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018073	A	6	6	4684	4689	100 %	0 %	0 %	0 %	392427896
109	NC_018073	GAT	2	6	4697	4702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427896
110	NC_018073	GA	3	6	4723	4728	50 %	0 %	50 %	0 %	392427896
111	NC_018073	A	7	7	4786	4792	100 %	0 %	0 %	0 %	392427896
112	NC_018073	GAA	2	6	4851	4856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427896
113	NC_018073	CAA	2	6	4876	4881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427896
114	NC_018073	TTAT	2	8	4957	4964	25 %	75 %	0 %	0 %	392427896
115	NC_018073	CTG	2	6	5014	5019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392427896
116	NC_018073	ATT	2	6	5043	5048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427896
117	NC_018073	AT	3	6	5051	5056	50 %	50 %	0 %	0 %	392427896
118	NC_018073	GTC	2	6	5095	5100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392427896
119	NC_018073	ACA	2	6	5112	5117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427896
120	NC_018073	ATT	2	6	5118	5123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427896
121	NC_018073	AGA	2	6	5150	5155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427896
122	NC_018073	AC	3	6	5173	5178	50 %	0 %	0 %	50 %	392427896
123	NC_018073	ATT	2	6	5206	5211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427896
124	NC_018073	AACA	2	8	5230	5237	75 %	0 %	0 %	25 %	392427896
125	NC_018073	CAA	2	6	5241	5246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427896
126	NC_018073	ATT	2	6	5269	5274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427897
127	NC_018073	ATT	2	6	5371	5376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427897
128	NC_018073	AG	3	6	5394	5399	50 %	0 %	50 %	0 %	392427897
129	NC_018073	TGATT	2	10	5457	5466	20 %	60 %	20 %	0 %	392427897
130	NC_018073	GAA	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427897
131	NC_018073	GAT	2	6	5506	5511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427897
132	NC_018073	T	7	7	5533	5539	0 %	100 %	0 %	0 %	392427897
133	NC_018073	T	6	6	5552	5557	0 %	100 %	0 %	0 %	392427897
134	NC_018073	T	6	6	5577	5582	0 %	100 %	0 %	0 %	392427897
135	NC_018073	CAA	2	6	5593	5598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427897
136	NC_018073	GCT	2	6	5623	5628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392427897
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138	NC_018073	TTAATT	2	12	5654	5665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427897
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